分類系統上設在種下的等級。在植物中，有些植株的性狀與基本種不同，而以往是以花色（大部分的白花）、株形（垂櫻）、葉形等某一性狀的差異來劃分變種，但最近，作為一個品種來考慮，則至少要有兩三點差異，并且占有不同的地理分布的類型才常作為變種來處理。在動物分類上存有輕視變種的傾向，動物的變種常有一部分被作為品種處理，在地理分布上不同的多作為亞種處理。命名上是把加有var．符號的變種小名附在種名之下來表示，不能單用變種小名來表示。變種小名的規定與種名的規定是一樣的。如日本垂櫻是江戶彼岸櫻（Prunus itosakura）的變種，但在命名上相反地則采取把江戶彼岸櫻為前者的變種型（Prunus Pendula var．ascendens）。
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