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分享|測序專業名詞解釋(一)

放大字體  縮小字體 發布日期:2024-04-07  來源:Gene Diagnosis公眾號
核心提示:1.什么是高通量測序?高通量測序技術(High-throughput sequencing,HTS)是對傳統Sanger測序(稱為一代測序技術)的改變, 一次對

1.什么是高通量測序?

高通量測序技術(High-throughput sequencing,HTS)是對傳統Sanger測序(稱為一代測序技術)的改變, 一次對幾十萬到幾百萬條核酸分子進行序列測定, 因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing,NGS )足見其劃時代的改變, 同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能, 所以又被稱為深度測序(Deep sequencing)。

2.什么是Sanger法測序(一代測序)

Sanger 法測序利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物。直到摻入一種鏈終止核苷酸為止。每一次序列測定由一套四個單獨的反應構成,每個反應含有所 有四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一種不同的雙脫氧核苷三磷酸(ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基團,使延長的寡 聚核苷酸選擇性地在G、A、T或C處終止。終止點由反應中相應的雙脫氧而定。每一種dNTPs和ddNTPs的相對濃度可以調整,使反應得到一組長幾百至 幾千堿基的鏈終止產物。它們具有共同的起始點,但終止在不同的的核苷酸上,可通過高分辨率變性凝膠電泳分離大小不同的片段,凝膠處理后可用X-光膠片放射 自顯影或非同位素標記進行檢測。

3.什么是基因組重測序(Genome Re-sequencing)

全基因組重測序是對基因組序列已知的個體進行基因組測序,并在個體或群體水平上進行差異性分析的方法。隨著基因組測序成本的不斷降低,人類疾病的致病突變研 究由外顯子區域擴大到全基因組范圍。通過構建不同長度的插入片段文庫和短序列、雙末端測序相結合的策略進行高通量測序,實現在全基因組水平上檢測疾病關聯 的常見、低頻、甚至是罕見的突變位點,以及結構變異等,具有重大的科研和產業價值。

4.什么是de novo測序

de novo測序也稱為從頭測序:其不需要任何現有的序列資料就可以對某個物種進行測序,利用生物信息學分析手段對序列進行拼接,組裝,從而獲得該物種的基因 組圖譜。獲得一個物種的全基因組序列是加快對此物種了解的重要捷徑。隨著新一代測序技術的飛速發展,基因組測序所需的成本和時間較傳統技術都大大降低,大 規模基因組測序漸入佳境,基因組學研究也迎來新的發展契機和突破。利用新一代高通量、高效率測序技術以及強大的生物信息分析能力,可以高效、低成本 地測定并分析所有生物的基因組序列。

編輯:songjiajie2010

 
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關鍵詞: 高通量測序
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