現代價鍵理論強調了分子中相鄰兩原子間因共享配對的電子而成鍵，能相當直觀并成功地解釋物質的化學性質，預測物質的分子結構。但由于過分強調了兩原子間的電子配對，而顯示出它的局限性，例如小分子B2，O2等的順磁性價鍵理論無法解釋。分子軌道(molecular orbital，MO)理論自然地、合理地解釋了這些現象。MO理論是美國化學家R．S Mulliken約在1932年創立的(獲1966年諾貝爾化學獎)。它可看成是量子
與VB理論是從不同側面探索研究分子結構的方法。在許多問題上，這兩個方法可得出一致結論。但有時則兩法各有其優缺點。因此目前兩種理論尚不可偏廢。不過由于計算機等新技術的興起、迅猛發展及廣泛應用，MO理論方法已成為當代研究分子結構的最普遍和最基本的理論方法。